Definition
Unter Metatranskriptomik versteht man die Analyse aller zu einem bestimmten Zeitpunkt aktiven RNA-Transkripte einer gesamten mikrobiellen Gemeinschaft (Mikrobiom) in einer Probe. Sie liefert ein funktionelles Bild der biologischen Aktivitäten des Mikrobioms.
Durchführung: Nach Entfernung der dominierenden ribosomalen RNA (mRNA) werden unter anderem untersucht:
- Bakterielle mRNA
- Pilz-mRNA
- Virale mRNA (bei RNA-Viren)
- RNA von Archaeen
Hinweis(e)
Der Nachweis von RNA oder fungalen Metaboliten kann zeigen, welche Mikroorganismen metabolisch aktiv sind. Dadurch lässt sich die bloße Anwesenheit von DNA besser von funktioneller Aktivität unterscheiden. Welche Gene sind aktiv? Welche Stoffwechselwege sind eingeschaltet? Welche Virulenzfaktoren werden produziert? Welche Resistenzgene sind aktiv? Wie verändert sich die Genexpression unter Therapie und Entzündung?
Metatranskriptomik beantwortet die Frage: Wer ist gerade aktiv und war tut er tatsächlich.
LiteraturFür Zugriff auf PubMed Studien mit nur einem Klick empfehlen wir 
Kopernio
Kopernio- Zhang Y et al. (2021) Metatranscriptomics for the Human Microbiome and Microbial Community Functional Profiling. Annu Rev Biomed Data Sci 4:279-311.
