HiSeq 4000

HiSeq 4000 (Hseq steht für High-Throughput Sequencing, also eine Sequenzierung mit sehr hohem Probendurchsatz) ist ein Hochdurchsatz-DNA-Sequenziergerät der Firma Illumina – genauer gesagt eine Plattform für Next-Generation Sequencing (NGS), also für die parallele Sequenzierung von Millionen an DNA-Fragmenten. Das Verfahren wird vor allem in Forschungslaboren und großen Genomzentren eingesetzt.

Der HiSeq 4000 ist ein automatisiertes Sequenziersystem, das auf der Illumina-Technologie des Sequencing-by-Synthesis (SBS) basiert und extrem große Mengen an DNA-Sequenzdaten in kurzer Zeit erzeugen kann. Es ist geeignet für: Ganzgenomsdequnezhierung, Exomsequenzierung, RNA-Sequenzierung (RNA-Seq), Epigenomik (z.B. Metyhlierungsanalysen).  

Grundprinzip:

• DNA wird fragmentiert und mit Adaptern versehen
• Die Fragmente werden auf einer sogenannten Flow Cell immobilisiert
• Dort werden sie durch Brückenamplifikation zu Clustern vervielfältigt
• Anschließend erfolgt die zyklische Sequenzierung mit fluoreszenzmarkierten Nukleotiden
• Das Gerät liest also parallel Millionen bis Milliarden DNA-Fragmente aus. In einem einzigen Sequenzierungslauf sind Analysen bis zu 1,5 Terabasen pro Lauf möglich.
• Die Laufzeit beträgt im Allgemeinen 3-4Tage pro Sequenzierungslauf.
• Der Einsatzbereich des Verfahrens lieg in der Genomik, der Transkriptomik und Epigenomik.