Wissenschaftszweig der für die Vereinigung von experimentellen und computerbasierten Fortschritten der Genomwissenschaften sowie für ein mehr ökologisches Verständnis der medizinischen Mikrobiologie hinsichtlich der Funktionen der einzelnen Mikroben und ihres Einflusses auf die Humanbiologie in Abhängigkeit vom Kontext zu anderen mikrobiellen Mitgliedern derselben Gemeinschaft steht. Während die Mikrobiologie sich traditionell auf diekulturelle Anzucht der jeweiligen Mikroben stützt, lässt die Metagenomik diesen Schritt aus und sequenziert direkt die aus einer bestimmten mikrobiellen Gemeinschaft gewonnene DNS.