Gen-ontologische Annotation
Synonym(e)
GO-Annotation
Definition
Eine Gen-ontologische Annotation (engl. Gene Ontology annotation, GO-Annotation) ist die standardisierte funktionelle Zuordnung eines Gens oder seines kodierten Produkts (RNA/Protein) zu definierten biologischen Begriffen aus der Gene Ontology. Sie dient zur Beschreibung seiner molekularen Funktion, seiner Beteiligung an biologischen Prozessen und seiner zellulären Lokalisation.
Bemerkungen:
- Ontologie= Lehre vom Sein; in der Informatik bezeichnet Ontologie ein geordnetes Modell von Begriffen und ihre Beziehungen zueinander).
- Annotation = Anmerkung.
Hinweis(e)
Beispiel (dermatologisch/immunologisch relevant)
Gen: IL17A
- Molekulare Funktion: „Zytokinaktivität“
- Biologischer Prozess: „Entzündungsreaktion“
- Zelluläre Komponente: „extrazellulärer Raum“
Diese Annotation erlaubt es, IL-17A sofort in Netzwerken der Psoriasis-Pathogenese einzuordnen.
Methodischer Kontext
- GO-Annotation ist Teil von:
- Bioinformatik
- funktioneller Genomik
- Systembiologie
Sie bildet die Brücke zwischen Sequenzdaten und klinisch interpretierbarer Biologie.